Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc175E9PVB3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms