Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kpna7C0LLJ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kpna7C0LLJ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms