Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms