Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zfc3h1B2RT41 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms