Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm2012B1B0R1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms