Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slfn8B1ARD8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms