Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttll11A4Q9F4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttll11A4Q9F4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms