Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plcb2A3KGF7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms