Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam43bA2AM80 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam43bA2AM80 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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