Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zkscan16A2ALW2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zkscan16A2ALW2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms