Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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