Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vstm4T1NXB5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms