Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CcniQ9Z2V9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms