Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms