Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nfs1Q9Z1J3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nfs1Q9Z1J3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms