Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cog1Q9Z160 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms