Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms