Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn3Q9Z0G9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms