Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUM4

Coro1c, Coronin-1C, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coro1cQ9WUM4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Coro1cQ9WUM4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms