Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn4Q9WU22 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn4Q9WU22 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms