Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fam50bQ9WTJ8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms