Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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