Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Irx4Q9QY61 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms