Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChmQ9QXG2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms