Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1Q9JM13 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rabgef1Q9JM13 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rabgef1Q9JM13 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Rabgef1Q9JM13 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Rabgef1Q9JM13 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rabgef1Q9JM13 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1Q9JM13 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms