Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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Tmod4Q9JLH8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Tmod4Q9JLH8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Tmod4Q9JLH8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmod4Q9JLH8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms