Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CubnQ9JLB4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms