Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cyp39a1Q9JKJ9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms