Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mrpl39Q9JKF7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms