Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nectin1Q9JKF6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nectin1Q9JKF6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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