Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnq4Q9JK97 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcnq4Q9JK97 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms