Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng4Q9JJV4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms