Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpf2Q9JJ80 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms