Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pgpep1Q9ESW8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms