Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ParvgQ9ERD8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms