Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndst3Q9EQH7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst3Q9EQH7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms