Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmg20aQ9DC33 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmg20aQ9DC33 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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