Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf6Q9DBU5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf6Q9DBU5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms