Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smg9Q9DB90 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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