Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH2

Znrf4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf4Q9DAH2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znrf4Q9DAH2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms