Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q9DAA3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms