Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem239Q9DA47 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms