Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmco5aQ9D9D5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmco5aQ9D9D5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tmco5aQ9D9D5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmco5aQ9D9D5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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