Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmem54Q9D7S1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Tmem54Q9D7S1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Tmem54Q9D7S1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmem54Q9D7S1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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