Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4cQ9D7F7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms