Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl40Q9D783 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms