Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nop56Q9D6Z1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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