Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PudpQ9D5U5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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