Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms