Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms